En el siglo IV, cuando se construyó la iglesia, ésta quedaba fuera de las murallas por eso se llamó "Chora" que significa" fuera de la ciudad o en el prado", más tarde, aunque la iglesia quedara dentro de las nuevas murallas de la ciudad que se construyeron por el crecimiento de ésta, su nombre no se cambió. La iglesia actual se construyó por orden de Maria Dukas, en el siglo XI y reconstruida hacia el siglo XII por Isaac Commeno, más tarde, Teodoro Metoquites hizo añadir el exonartex y la parakklesia (cripta) de la iglesia. La iglesia fue transformada en mezquita por orden de Atik Ali Pacha, gran visir de Bayaceto II. Se le añadió un minarete en el exterior de la iglesia y los mosaicos fueron recubiertos con una capa de cal hacia el año 1765. El museo de Kariye es el que posee los mosaicos y frescos más hermosos del mundo bizantino.

Sería provechoso empezar la visita por la nave de la iglesia. Los mosaicos de mármol colorido del suelo y las placas de mármol que recubren las paredes de la iglesia le dan un aire de amplitud. El mihrab otomano que se encuentra en el ábside de la iglesia está orientado hacia el sureste, por eso no esta situado en el horizonte medio de la iglesia. La cúpula de la iglesia fue restaurada en numerosas ocasiones.

En la nave podemos observar tres escenas de mosaicos del siglo XIV. A la derecha del ábside se ve a la Virgen con el Niño, a la izquierda los mosaicos de los apóstoles parcialmente estropeados. La escena de la Ascensión de la Virgen, encima de la puerta de la entrada a la nave, está en muy buen estado de conservación. En esta escena, alrededor de la Virgen, tumbada en una cama, se ve a Jesús, los apóstoles y los ángeles.